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2ème journée HeRacLeS - 18 octobre 2023
12
oct
2023
Alexis Lebon
Webseminaire Confocal.nl, vendredi 30 juin 2023
15
juin
2023
Magalie Bénard
Journées Thématiques « MAIIA » : Méthodes d'analyses d'images par Intelligence Artificielle
22
mai
2023
Il reste quelques places pour ces journées qui ont lieu à PRIMACEN !!!
Inscrivez-vous vite
ICI
Programme
Lundi 19 juin
12h30-13h00 Accueil des participants et café
13h00-14h00 Présentation D. Sage, EPFL, “
Navigating into Deep-Learning Bioimage Analysis: Strategies, Tools, Models, and Data
”
14h00-14h15
Présentation FBI Data
14h15-15h00
Flash Talk des participants: “Mes objets à segmenter” (une dia). Q&A si le temps
15h00-16h00
Succès et Échecs: quelques exemples OU Présentation générale : ce qu'il faut savoir avant d'entraîner un réseau (équipement, installation, jeux de données, métriques, etc ...)
16h00-16h30
Pause café
16h30-18h00
Atelier pratiques en sous-groupes: StarDist, Cellpose, ilastik
18h00-18h30
Mise en commun des travaux des ateliers pratiques
19h30
Dîner de groupe
Mardi 20 juin
09h00-10h00
L'importance du contrôle qualité et l'utilisation du plugin MiC.
10h00-10h30 Pause café
10h00-12h30 Groupe: StarDist, Cellpose, ilastik ou annotations party: : comment annoter ses images pour créer des vérités terrain et des jeux de données pour ré-entraîner un réseau ML/DL.
12h30-13h00 Conclusions des journées thématiques
Christophe Chamot
[Rendez-vous LORIER] Pourquoi faut-il Agir à l'Inserm ?
17
mai
2023
Alexis Lebon de PRIMACEN présentera le 13 juin de 11 h à 12 h lors du prochain RDV LORIER l'application Agir.
Agir est un outil de pilotage des activités à risques rencontrées dans les laboratoires qui simplifie l'accès aux informations en les centralisant et harmonise les pratiques, fournit une cartographie précise des risques à diverses échelles et facilite, in fine, le dialogue entre les chercheurs, le personnel technique et les services supports.
Inscription ici
Alexis Lebon
Formation sur le design d'amorces avec le logiciel primer express pour la PCR temps réel
08
mar
2023
Nous organiserons
une formation sur le design d'amorces avec le logiciel primer express pour la PCR temps réel
(Q-PCR) le j
eudi 16 mars de 13 h 30 à 15 h 30
en salle de réunion de PRIMACEN (4ème étage du CURIB). A l'issue de la formation, il sera possible de voir les robots Agilent Bravo et systèmes Quantstudio 12 KFlex disponibles sur PRIMACEN. Pour vous inscrire, envoyez un mail à
david.vaudry@inserm.fr
David Vaudry
Présentation sur la Biologie Spatiale
08
mar
2023
Lundi 13 mars à 13 h 30, la société 10X GENOMICS fera une présentation de ses technologies de biologie spatiale: - Visium (transcriptomique spatiale) - Xenium (hybridation et analyse in situ, à l'échelle subcellulaire).
La présentation se fera en distantiel avec la société 10X genomics, mais ceux qui le souhaitent peuvent venir en salle 66 du CURIB pour suivre la visioconférence pour plus de convivialité et d'échanges.
Le lien pour se connecter est :
Cécile Cesarini (10x Genomics) is inviting you to a scheduled Zoom meeting.
Join Zoom Meeting
https://10xgenomics.zoom.us/j/96491011281?pwd=YTFzQlJzYXJpUzcwdkJLNkEvdlRxZz09
David Vaudry
Workshop MICA / AIVIA - 14 au 17 Mars 2023
26
fev
2023
Magalie Bénard
Formation Inserm
14
fev
2023
Magalie Bénard
Formation Inserm
14
fev
2023
Magalie Bénard
Formation Imaris - 1er mars 2023
08
fev
2023
Dans le cadre de la mise à niveau de la station haute performance d'analyses d'images Imaris, rendue possible par le projet Amiral (FEDER), PRIMACEN et la société Andor organisent une
journée dédiée au logiciel Imaris
.
Imaris est un logiciel interactif de visualisation et d'analyse d'images microscopiques en 3D, 4D ou 5D et en temps réel, avec des solutions avancées pour les grands ensembles de données pour réaliser des instantanés et des animations, générer des informations quantitatives (surface, volume, vitesse, distance...), des études de co-localisation, des tracés et des analyses statistiques.
Cette manifestation se déroulera le
1er mars 2023
, au sein du
CURIB
à Mont Saint Aignan, et s'articulera en deux parties :
- une
présentation
du logiciel Imaris dans sa version 10, de 10h à 12h dans l'amphithéatre
- des
ateliers
à partir d'images issues de vos acquisitions, de 13h à 17h30 dans la salle 406
Cette journée est gratuite mais l'
inscription est obligatoire, en cliquant
ici
, avant le 24 février.
Si vous êtes intéressés par les ateliers, merci d'adresser vos images et vos problématiques à Alexis Lebon (alexis.lebon@univ-rouen.fr) avant le 24 février.
Alexis Lebon
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