Outils d'analyse de données en Imagerie,
Génomique et Protéomique
18 Novembre 2011
Mont-Saint-Aignan (Université de Rouen)
Programme
Liste des ateliers
Formulaire d’inscription
Localisation
Programme
9 h 15 – 9 h 30
Accueil
9 h 30 – 10 h 15
Conférence Imagerie
10 h 20 – 11 h 50
Atelier 1
11 h 50 – 13 h 15
Repas avec présentation des outils
iPRIMACEN
et
PrIMS
13 h 15 – 14 h 00
Conférence Protéomique
14 h 05 – 15 h 35
Atelier 2
15 h 40 – 17 h 10
Atelier 3
La conférence Imagerie
« Traitement et analyse d’images en biologie : art ou science ? »
sera donée par Christophe Chamot, ingénieur et responsable technique du PLAteau Technique Imagerie/Microcopie
(PLATIM,
http://www.ifr128.prd.fr/PLATIM/
) à l’ENS Lyon.
« Traitement et analyse d'images sont souvent les parents pauvres de la biologie, scientifiquement parlant. Parfois à tort. Une grande majorité de chercheurs en biologie cherchent une simple illustration de leur propos. L'avènement du numérique permet à l'imagerie de faire son entrée dans le domaine des sciences, en tant que sous-domaine du traitement du signal, à la frontière de l'informatique, des mathématiques et de la physique.
L’idée du propos est de montrer, à travers d'exemples simples, les apports du traitement d'images et de l'analyse d'images à un thème de recherche. Exemple typique : l'étude de la co-localisation de deux marqueurs et l'analyse morpho-mathématique.»
La conférence de Protéomique
« Analyse SILAC via MAXQUANT : application à l'identification de marqueurs d'apoptose neuronale »
sera donnée par Serge Urbach, ingénieur CNRS sur la Plate-forme Protéome IBiSA de Montpellier.
Liste des ateliers
Pour chacune des trois séances (Atelier 1, Atelier 2, Atelier 3),
vous pouvez choisir un atelier différent parmi la liste ci-dessous :
Ateliers : Imagerie
Traitement et analyse d’images expérimentales avec
ImageJ
Damien Schapman
Analyse multidimensionnelle avec
Imaris
Alexis Lebon
Analyse d'images avec
MetaMorph
Magalie Bénard
Analyse d'images de puces à protéines avec les logiciels
R
,
imview
et
SPOT
Arnaud Desfeux
Merci de cliquer sur la loupe pour obtenir plus d'informations
Ateliers : Génomique
qbase
PLUS
et
DataAssist
pour analyser les données de PCR quantitative
Alexis Lefebvre
Découverte des fonctionnalités de
GeneSpring
pour l’analyse des données de microarray
Céline Derambure
Merci de cliquer sur la loupe pour obtenir plus d'informations
Ateliers : Protéomique
Analyse comparative de gels d'électrophorèse bidimensionnelle avec
SameSpots
Bertrand Naudin
Identification de protéines après analyse MS ou MS/MS avec
Spectrum Mill
Frédérique Jarnier
Identification de protéines après analyse MS ou MS/MS avec
Mascot
Laurent Coquet
Séquençage
de novo
à l’aide du logiciel
PEAKS
Pascal Cosette
Merci de cliquer sur la loupe pour obtenir plus d'informations
Formulaire d’inscription
Les inscriptions sont closes pour cette journée.
Pour plus d'informations, merci de contacter
David Vaudry
